付款单位的开户银行在处理逾期支付款项时，会根据逾期金额和天数来计算赔偿金。具体来说，如果付款单位未能按时支付款项，银行将按照每日万分之三的比例计算逾期赔偿金，并将其与原应支付的款项一同划转给收款单位。值得注意的是，逾期天数是从承付期满日算起的。如果承付期满日银行营业结束而付款单位没有足够的资金支付，那么不足部分将从次日开始计算赔偿金。
对于多次违约且不履行合同规定的付款单位，其开户银行会通知收款单位的开户银行停止对该付款单位办理托收业务。如果收款单位不顾警告继续进行托收操作，则从发出通知后的一个月内收到的任何托收凭证都将被拒绝受理，并需注明拒绝理由后退回原件。此外，若付款单位长时间占用单证不退还，其开户银行还将暂停该单位对外地结算业务的资格。
