根据《财政部、国家税务总局关于全国实施增值税转型改革若干问题的通知》（财税[2008]170号）第五条规定，纳税人已抵扣进项税额的固定资产发生条例第十条（一）至（三）项所列情形的，应在当月按下列公式计算不得抵扣的进项税额：不得抵扣的进项税额=固定资产净值×适用税率。因此，如果企业固定资产被盗，应将固定资产净值部分对应的进项税额进行转出处理。
