当专业款项被视为财政补助时，应采取如下会计处理：
首先，借记银行存款账户，以反映资金的实际到账情况。
其次，根据是否采用新会计准则，贷记不同的科目。若未使用新准则，则贷记营业外收入-财政补助；若已采用新准则，则贷记其他收益科目。
此外，对于企业从县级以上各级人民政府财政部门或其他部门取得的应计入收入总额的财政性资金，如果同时满足以下三个条件，可以免征企业所得税：
一是企业能够提供规定资金专项用途的资金拨付文件；
二是财政部门或其他拨付资金的政府部门对该资金有专门的资金管理办法或具体管理要求；
三是企业对该资金以及以该资金发生的支出单独进行核算。
