企业存货报废的账务处理流程如下：
首先，当企业发生存货报废时，需要做以下会计分录：
借：待处
理财产损溢 贷：库存商品或原材料 应交税费-应交增值税(进项税额转出)
这一步骤的目的是将存货报废的损失计入待处理财产损溢科目，同时减少库存商品或原材料的价值，并将不能抵扣的增值税进项税额转出。
接下来，根据存货报废的原因进行进一步的处理：
1. 如果是因为非正常原因（如管理不善导致被盗、丢失、霉烂变质）导致的存货盘亏或毁损，按规定不能抵扣的增值税进项税额应当予以转出。
2. 如果是因为意外灾害导致的存货盘亏或毁损，且增值税进项税额可以抵扣的，则不需要转出。
然后，在处理过程中，需要按照管理权限报经批准后，根据造成存货盘亏或毁损的原因进行具体的会计处理：
1. 如果存在回收残料价值，则借记“原材料”科目。
2. 如果存在应收的赔偿款项，则借记“其他应收款”科目。
3. 如果是由于计量收发差错、一般经营损耗以及管理不善造成的存货盘亏，则借记“管理费用”科目。
4. 如果是由于自然灾害等非常原因造成的存货盘亏，则借记“营业外支出”科目。
最后，将所有借方科目对应的贷方科目为“待处理财产损溢”。
